雀纹天蛾Theretra japonica (Boisduval, 1869) 隶属于鳞翅目Lepidoptera天蛾科Sphingidae 斜纹天蛾属Theretra,其广泛分布于中国、朝鲜、韩国、俄罗斯和日本,在我国除新疆、宁夏外各地区均有分布。雀纹天蛾是一种重要的传粉昆虫,是臭牡丹,紫茉莉,百合等植物的主要传粉昆虫之一;同时,雀纹天蛾也是一种农业害虫,其寄主植物种类繁多,广泛侵害芋属、月见草属、绣球属、蛇葡萄属、乌蔹莓属、地锦属、葡萄属及露珠草属等多种植物,通常于每年6月至10月间危害,危害特别严重时,植物的叶片几乎殆尽,仅剩下叶脉、枝条等,甚至全株枯死,严重影响了植物的生长及用途。
图1 雀纹天蛾标本照
近日,王旭副教授团队结合二代、三代基因组测序技术及Hi-C辅助技术,首次破译雀纹天蛾这一重要的传粉及农、林业害虫的基因组,完成了雀纹天蛾的染色体水平基因组组装。结果显示,雀纹天蛾基因组大小为409.55 Mb,scaffold与contig数量分别为95和101,scaffold N50与contig N50长度分别为14.58和14.27 Mb,CG含量为37.16%,29条假染色体(pseudochromosomes)共403.77 Mb,挂载率为98.59%。二代survey、二代RNA、三代RNA以及三代Hifi数据回帖率分别达96.84%、99.97%、89.21%和74.43%,基因组组装BUSCO评估完整性为99.2%,以上指标均说明雀纹天蛾基因组组装无论是在连续性、完整性上都达到很高的水准。该成果于7月12日以“Chromosome-level Genome assembly of Theretra japonica (Lepidoptera: Sphingidae)”为题发表在Nature子刊Scientific Data期刊(中科院二区,IF=9.8),安徽师范大学为第一完成单位,王旭副教授为论文通讯作者,硕士研究生严明为第一作者。
原文链接:https://doi.org/10.1038/s41597-024-03500-z
图2 雀纹天蛾基因组特征