本网讯(生科院 李明会)628日下午,生命科学学院第4期青芒论坛活动在赭山校区图书馆报告厅举行。院长朱国萍、副院长王鹏、学院中青年教师及相关专业研究生参加了本次活动。此次论坛由王鹏副院长主持。

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龙红岸教授作报告

首先,来自中国海洋大学水产学院海洋生物多样性与进化研究所的龙红岸教授做了《自发与诱导突变》的主题报告。报告中,龙教授从为什么要研究突变等科学问题出发,通过对30种细菌、1种古菌以及10种原生生物的广泛取样,结合基于全基因组和转录组测序的变异积累实验,阐明了微生物基因组自发变异的形成机制和突变规律,以及碱基含量、突变率等的演化决定因子。另一方面,龙教授介绍了微生物在抗生素、纳米银、pH值以及农药等环境胁迫下的诱导突变规律。龙教授的工作表明,微生物突变的产生和修复都不是随机的,突变倾向性在基因组碱基含量演化中扮演重要角色,突变率的下限则受drift-barrier决定,pH下降在降低突变率的同时还可以使突变谱朝着GC碱基对增加的方向改变,某些抗生素可以通过应急响应提高突变率等。除此之外,龙教授在报告末尾还介绍了未来关于突变研究的一些设想,指出未来的突变研究主要聚焦于难培养的微生物的突变规律,以及微生物在自然界中的突变规律研究等等。

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沈亮副教授作报告

随后,生科院沈亮副教授做了《极地和山地环境节细菌(Arthrobacter)基因组研究》的主题报告。沈亮副教授的研究领域主要是冰川微生物,基于基因组测序手段,首先建立了高质量、非冗余的参考基因组,构建系统发育树并率先在业内建立起了F measure 0.95这一极地和山地环境可操作单系类群筛选标准,筛选出了一支可操作极地和山地特有单系类群。接下来采用纯培养,从生理层面给出了该特有单系类群属于极地和山地菌株的证据。为了进一步阐明该单系类群和中温类群以及广布类群之间的区别,沈老师对比了三种类群的低温适应性的基因组表现,发现该特有单系类群不但GC含量低,且GC含量与氨基酸比例互相影响。通过进一步SWISS-MODEL蛋白质建模发现,氨基酸比例的改变增加了蛋白质低温下的吉布斯自由能,从而建立了GC含量与蛋白质稳定性之间的联系。最后进行了基因功能富集分析,并对上述三个类群的生态学意义进行了探讨,为变暖环境下极地和山地环境微生物生态学研究提供了依据。

每场报告结束,参会老师及研究生都对感兴趣的学术问题与报告专家展开了热烈的讨论和交流,两位老师幽默风趣,现场气氛热烈。